ماریو و لوئیجی به همراه پرنسس پیچ و تود به ماجراجویی در دورترین نقاط فضا و سراسر کهکشان می‌پیوندند، جایی که در برابر پسر باوزر، یعنی باوزر جونیور، قرار می‌گیرند که در تلاش است پدرش را از کوچک و زندانی شدن نجات داده و آزاد کند و ...

داستان انیمیشن در مورد لوله‌کشی به نام ماریو است که به همراه برادرش لوئیجی به یک هزارتوی زیرزمینی وارد می‌شود تا یک شاهزاده خانم را که در این هزارتو اسیر شده، نجات دهد. اما ...